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PDMのAPIにはファイル名変更のメゾットがありますので、ファイル名変更はできると思います。
あとは、ファイル名変更のリストみたいなのがあるのであれば、
Excelの64ビット版のVBAで、PDMのAPIを使うのが簡単かと思います。

流れとしては、
　Excelのセルから元ファイル名と変更先のファイル名を読み取り、
　PDMでファイルを検索して、
　チェックアウトされてないかチェックして
　ファイル名を変更、
　必要ならExcelのセルに結果を記載
のループでできるのではないでしょうか。

山本さん、柳井さん
ご回答いただきありがとうございます。
API勉強しないといけないですね。。。使ったことないので((+_+))
いろいろと考えてみたいと思います。

亀レスですが、、、

PDMのディスパッチ機能（Professional限定？）を使ってカード情報（弊社だと部品番号や部品名称）から属性情報を参照して、所定のステータスに遷移した際に、名称変更を行っています。